alla flaggor
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  forky  ] [  sid  ] [  experimental  ]
[ Källkod: minimap2  ]

Paket: python3-mappy (2.27+dfsg-1 och andra)

Länkar för python3-mappy

Screenshot

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet minimap2:

Ansvariga:

Externa resurser:

Liknande paket:

Python3 interface minimap2

Minimap2 is a versatile sequence alignment program that aligns DNA or mRNA sequences against a large reference database. Typical use cases include: (1) mapping PacBio or Oxford Nanopore genomic reads to the human genome; (2) finding overlaps between long reads with error rate up to ~15%; (3) splice-aware alignment of PacBio Iso-Seq or Nanopore cDNA or Direct RNA reads against a reference genome; (4) aligning Illumina single- or paired-end reads; (5) assembly-to-assembly alignment; (6) full- genome alignment between two closely related species with divergence below ~15%.

This package contains the Python3 interface for using minimap2.

Andra paket besläktade med python3-mappy

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • enhances

Hämta python3-mappy

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Version Paketstorlek Installerad storlek Filer
alpha (inofficiell anpassning) 2.27+dfsg-1+b3 198,4 kbyte958,0 kbyte [filförteckning]
amd64 2.27+dfsg-1+b4 171,8 kbyte694,0 kbyte [filförteckning]
arm64 2.27+dfsg-1+b5 169,3 kbyte826,0 kbyte [filförteckning]
armhf 2.27+dfsg-1+b4 178,4 kbyte562,0 kbyte [filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning) 2.27+dfsg-1+b4 201,1 kbyte886,0 kbyte [filförteckning]
i386 2.27+dfsg-1+b4 206,5 kbyte982,0 kbyte [filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning) 2.24+dfsg-3+b1 256,8 kbyte1.500,0 kbyte [filförteckning]
loong64 (inofficiell anpassning) 2.27+dfsg-1+b4 181,7 kbyte826,0 kbyte [filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning) 2.27+dfsg-1+b2 167,8 kbyte784,0 kbyte [filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning) 2.27+dfsg-1+b4 205,7 kbyte1.082,0 kbyte [filförteckning]
ppc64el 2.27+dfsg-1+b4 196,1 kbyte954,0 kbyte [filförteckning]
riscv64 2.27+dfsg-1+b4 205,7 kbyte666,0 kbyte [filförteckning]
s390x 2.27+dfsg-1+b4 217,8 kbyte954,0 kbyte [filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning) 2.27+dfsg-1+b2 206,1 kbyte428,0 kbyte [filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning) 2.27+dfsg-1+b4 174,8 kbyte2.116,0 kbyte [filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning) 2.27+dfsg-1+b1 177,9 kbyte738,0 kbyte [filförteckning]